Mission Bay is misschien niet de meest gewilde duiklocatie, maar het is een betrouwbare alternatieve plek, vooral voor open water cursussen wanneer de oceaanomstandigheden niet ideaal zijn. De beschutte wateren garanderen een rustige duikervaring, hoewel de zichtbaarheid soms beperkt kan zijn. Duikers kunnen zeebassen, schorpioenvissen en stekelroggen tegenkomen, evenals interessante ontdekkingen zoals octopussen, kreeften, krabben en verschillende kleine vissen tussen de rotsen van de steigers.