Mission Bay potrebbe non essere il sito di immersione più ambito, ma è una valida alternativa, soprattutto per i corsi di acque libere quando le condizioni marine non sono favorevoli. Le acque protette garantiscono una calma perfetta, anche se la visibilità non è sempre eccellente. I subacquei possono imbattersi in pesci serra, sculpins e razze, oltre a cercare polpi, aragoste, granchi e pesci più piccoli tra le rocce dei moli.
